神秘的基因组测序，究竟如何帮助我们控制疫情？

By 新西兰中文先驱网· 2021年08月19日 00:03

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新西兰中文先驱网 Charles 综合

英文《先驱报》科学条线记者Jamie Morton认为，基因组测序的结果可能对此次疫情的规模和封锁时间产生至关重要的影响。

什么是基因组测序?

基因组测序可以生成病毒的“基因指纹”，帮助公共卫生官员通过病毒的基因序列从一团乱麻中理出头绪，划分感染集群。

我们可以把整个基因组想象成一个由拼图碎片组成的盒子，这些碎片构成了地球上所有生物的遗传之谜。

在我们自己的盒子里有22对常染色体，和1对性染色体用来区分性别。

它由DNA双螺旋结构(脱氧核糖核酸)组成，包含约3万个基因，以及帮助将DNA链固定在一起的30亿个化学碱基。

新冠病毒也有自己的拼图。但它的不同之处在于它是由核糖核酸或RNA组成的，是单链而非像DNA那样的双链。

它只有3万个碱基，组成了15个特定的基因。

科学家们通过一种叫做测序的过程，将这些谜题拼凑在一起，弄清基因组中碱基的顺序，然后将它们组装起来，从而获得一个DNA的完整图像。

基因组测序是如何帮助我们的?

在新西兰的第一波疫情中，科学家对649例不同病例的基因组进行了测序，揭示了来自世界不同地区的近300种不同的病毒类型。

随后，在2020年的“奥克兰8月集群”中，基因组测序、以及接触者追踪等其他工具，迅速帮助卫生官员串联起了传播链。

由于迄今为止新西兰的病例相对较少，科学家们一直在对通过MIQ入境的每一个阳性病例样本进行测序。这样一来，一旦社区出现病例，可以迅速溯源。

这次，基因组测序已经告诉我们，我们面对的是Delta毒株，而且毒株来自澳大利亚新南威尔士州。

科学家们还将对此次疫情中出现的病例进行基因组测序，以帮助追踪。

我们在等待什么结果?

8月份，只有3例来自悉尼的病例通过了新西兰的MIQ，科学家们已经迅速对这些病例的样本进行了基因组测序。

对于快速或紧急样本，测序通常可以在24小时内得出结果。

如果这些病例中有一例与当前的疫情有关，官员们就能清楚地知道边境与疫情之间的联系，并缩小对传播链的搜索范围。

建模专家Rachelle Binny说：“如果接触者追踪和基因组测序可以确定病毒何时从新州传入新西兰，我们就能更好地估算出传播链的范围，以及有多少未被发现的社区病例。”

另一位建模专家Shaun Hendy说，最好的情况是基因组与MIQ或另一个边境点（如港口）有关联。这种情况下，感染集群的规模可能不会很大，反之，当前的病例恐怕仅为冰山一角。

而关于病毒的传入则更为扑朔迷离，一种情况是，最初带来的病毒的是一名澳洲旅客，在“澳新泡泡”关闭前来到新西兰，那就意味着，病毒的传播从很早之前就开始了。

然而，到目前为止，社区检测和废水检测等指标都没有显示出阳性，似乎没有大规模的隐性疫情。

政府同时在联系所有在相关时间段内从澳洲进入新西兰的旅客，以确定0号病例。

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